Einführungsbeitrag

Dieses Dokument legt die entscheidenden Schritte eines Verfahrens der quantitativen Real-time-Polymerase-Kettenreaktion (qPCR) zur Messung der Häufigkeit ausgewählter mikrobieller Gensequenzen aus Boden-DNA-Extrakten fest, welche eine Schätzung ausgewählter mikrobieller Gruppen ermöglicht. Dabei gilt, dass die Anzahl von Genen nicht zwangsläufig direkt mit der Anzahl an gemessenen Organismen korreliert. Zum Beispiel reicht die Anzahl des ribosomalen Operons in unterschiedlichen Bakterienstämmen von einer Kopie bis zu 20 Kopien. Daher ergibt die Anzahl der 16S-rRNA-Sequenzen, die aus Boden-DNA-Extrakten quantitativ bestimmt wurde, keinen genauen Schätzwert für die Anzahl der Bodenbakterien. Außerdem ist die Anzahl der Sequenzen nicht unbedingt mit lebenden Mikroorganismen verbunden und kann auch Sequenzen umfassen, die von toten Mikroorganismen amplifiziert wurden. Eine Auflistung derzeit gängiger qPCR-Analysen zur Beurteilung ausgewählter funktioneller Merkmale des Boden-Mikrobioms ist in Anhang C aufgeführt. Das zuständige nationale Normungsgremium ist der Unterausschuss NA 119-01-02-04 UA "Biologische Verfahren" im DIN-Normenausschuss Wasserwesen (NAW).

Änderungsvermerk

Gegenüber DIN EN ISO 17601:2018-08 wurden folgende Änderungen vorgenommen: a) Anhang C wurde um Beispiele für etablierte qPCR-Systeme zur Quantifizierung bestimmter mikrobieller Gruppen oder ihrer Funktion erweitert; b) Dokument redaktionell überarbeitet.

Zuständiges nationales Arbeitsgremium

NA 119-01-02-04 UA - Biologische Verfahren  

Zuständiges europäisches Arbeitsgremium

CEN/TC 444 - Umweltbezogene Charakterisierung fester Matrices  

Zuständiges internationales Arbeitsgremium

ISO/TC 190/SC 4/WG 4 - Wirkung auf Mikroorganismen